Ann Rheum Dis：全腸道(dào)病毒組分析揭示了噬菌體與自身免疫性疾病之間的聯系

背景：許多自身免疫性疾病是由複雜的遺傳和環境因素及其相互作用引起(qǐ)的。其中自身免疫疾病的遺傳因素通過(guò)各種(zhǒng)研究揭示，例如全基因組關聯研究。腸道(dào)微生物群，指的是定居在我們腸道(dào)内的微生物群落，通過(guò)免疫和代謝系統對(duì)我們的健康産生重大影響。随著(zhe)分析方法的進(jìn)步，許多研究揭示了腸道(dào)微生物群與人類疾病如代謝性疾病、癌症、腸道(dào)疾病之間的複雜關系。至于自身免疫疾病，腸道(dào)微生物群被認爲是其發(fā)展過(guò)程中最重要的貢獻者之一。
目的：既往已經(jīng)深入的研究了自身免疫性疾病與腸道(dào)微生物群的關系，并确定了幾種(zhǒng)與自身免疫相關的細菌類群。然而，對(duì)腸道(dào)病毒在自身免疫性疾病中的作用知之甚少。
方法：在此，我們對(duì)476名日本人進(jìn)行了全腸道(dào)病毒體測序分析，這(zhè)些日本人包括類風濕性關節炎患者、系統性紅斑狼瘡患者、多發(fā)性硬化患者和健康對(duì)照受試者。
結果：我們對(duì)病毒豐度的病例對(duì)照比較顯示，在自身免疫性疾病患者，特别是類風濕性關節炎(RA)和系統性紅斑狼瘡(SLE)患者的腸道(dào)中，作爲健康腸道(dào)病毒主要成(chéng)分之一的crAss樣噬菌體顯著減少。此外，SLE患者腸道(dào)中的Podoviridae明顯減少。爲了了解這(zhè)些病毒是如何影響細菌體的，我們進(jìn)行了定量的病毒-細菌關聯分析，并進(jìn)行了病毒-細菌相互作用分析。結果顯示，Podoviridae和Faecalibacterium豐度之間存在正相關，基于CRISPR的病毒-細菌相互作用分析提供了噬菌體感染的直接證據。拟杆菌門(Bacteroidetes)和厚壁菌門(Firmicutes)，包括Ruminococcus spp，檢測爲crAss樣噬菌體的宿主，這(zhè)些噬菌體在多個樣本中複制。
結論：我們的數據表明腸道(dào)病毒可以直接或通過(guò)細菌影響我們的身體。我們的分析闡明了先前缺失的與自身免疫相關的腸道(dào)微生物群，并提出了有助于自身免疫疾病發(fā)展的新候選基因。
原文出處：TomofujiY,KishikawaT,MaedaY,et al.Whole gut virome analysis of 476 Japanese revealed a link between phage and autoimmune disease.Ann Rheum Dis2021 Dec 08