淺談噬菌體生物庫的建設

當前的噬菌體治療常常需要根據患者感染的細菌快速匹配出合适的噬菌體以進(jìn)行個體化治療。這(zhè)種(zhǒng)情況下，建立存儲有大量噬菌體的噬菌體生物庫對(duì)提高患者感染細菌與噬菌體的匹配速度至關重要。
一個綜合性的噬菌體生物庫，必須對(duì)噬菌體的收集和數據整理等進(jìn)行有效的管理。理想狀态下，噬菌體生物庫的建立應該能(néng)滿足本國(guó)甚至全球使用的噬菌體資源和數據。本文以澳大利亞噬菌體生物庫建庫的背景，了解建立一個國(guó)家級噬菌體資源庫，應該具備的幾大基本特征。
1.集中管理 
一個有效的噬菌體生物庫將(jiāng)作爲一個網絡中心點，通過(guò)共享協議將(jiāng)噬菌體資源與臨床應用有機連接，并進(jìn)行有效管理。
2.标準化的程序 
對(duì)噬菌體的分離、純化、鑒定和加工環節，制定标準化的程序，有效的提高噬菌體收集、存儲和運輸的效率。拟定一份标準化的跨機構噬菌體轉移協議模闆，讓參與者能(néng)夠從噬菌體庫快速的獲取噬菌體。另外，引入國(guó)際标準化的質量管理系統將(jiāng)有助于保證質量，提高使用者和相關利用者之間的信心。
3.标準化的定義 
根據國(guó)際病毒分類委員會(huì)制定的标準，對(duì)噬菌體生物庫裡(lǐ)的噬菌體進(jìn)行基因組測序和标準化的基因組注釋非常重要，將(jiāng)促進(jìn)生物标本導航平台的使用，并允許開(kāi)發(fā)簡單有效的工具，例如“噬菌體護照（ID）”。更具體的說(shuō)就(jiù)是，标準化噬菌體産品的質量參數。關于“噬菌體護照”的定義，可能(néng)會(huì)有區域性的差異，但是理想狀态下應該是共同商定全球适用。可根據圖2了解“噬菌體護照”規則納入噬菌體臨床治療策略的重要性。
4.有效的診斷 
噬菌體的臨床應用需要將(jiāng)患者感染的細菌與候選噬菌體進(jìn)行匹配，甚至需要測定噬菌體與抗生素聯用的效果。這(zhè)些治療前診斷在噬菌體生物庫進(jìn)行是最合适的，將(jiāng)噬菌體與細菌的監測系統整合起(qǐ)來，有助于匹配上最有效的噬菌體。
5.數據管理 
标準化的數據管理和高效的實驗室信息管理系統很有必要的，其中生物标本導航平台可以快速的定位噬菌體制劑存放的具體位置。另外，將(jiāng)已發(fā)表的噬菌體試驗數據、未發(fā)表的和同行評審的臨床研究和病例報告以及其他公開(kāi)的可用數據整合起(qǐ)來，促進(jìn)合作，爲未來的臨床實驗提供信息，讓研究人員和臨床醫生能(néng)夠借鑒，并進(jìn)行有效的合作。對(duì)這(zhè)些數據進(jìn)行整理時(shí)，最好(hǎo)成(chéng)立專家小組進(jìn)行有效的審查。
6.制造和生産 
當前包括有霧化、敷料、灌洗、注射等幾種(zhǒng)噬菌體給藥途徑被證明對(duì)治療人類感染的細菌是有效的。其中，高純度、安全含量内毒素的噬菌體制備是噬菌體進(jìn)行靜脈注射治療時(shí)必須的。如何提高高質量的噬菌體的制備工藝和基礎設置，有效的對(duì)噬菌體生産進(jìn)行管理，以确保精準的靶向(xiàng)治療，也是噬菌體生物庫建設中需要思考的一個重要環節。
綜上所述，在任何噬菌體生物庫的建設過(guò)程中都(dōu)是需要綜合考慮道(dào)德、法律、财務和管理等因素。如何建立一種(zhǒng)合理的商業模式，以簡化用于制藥和生物技術研發(fā)的臨床菌株和噬菌體獲取是值得思考的問題。另外，有公共資金、政府機構支持和合作對(duì)噬菌體生物庫的可持續發(fā)展也是至關重要的，一個全球範圍适用的互聯共通的噬菌體生物庫的建立對(duì)于減抗行動，遏制耐藥菌感染是有重要意義的。
參考文獻：
Lin, R.C., et al., PhageBiobank: Present Challenges and Future Perspectives. Curr Opin Biotechnol,2021. 68: p. 221-230.